Για την εγγραφή μαθητών στο Μουσικό Σχολείο Ιωαννίνων, για το σχολικό έτος 2016-2017, οι γονείς ή κηδεμόνες των μαθητών, που επιθυμούν να συμμετάσχουν στη διαδικασία επιλογής, οφείλουν να υποβάλλουν αίτηση απευθείας στο Μουσικό Σχολείο κατά το χρονικό διάστημα από 10 Μαΐου έως και 31 Μαΐου.
Οι υποψήφιοι για επιλογή και φοίτηση στην Α΄ τάξη Γυμνασίου των Μουσικών Σχολείων δεν στερούνται του δικαιώματος υποβολής αίτησης για συμμετοχή στις διαδικασίες εισαγωγής σε άλλο Πρότυπο Πειραματικό Γυμνάσιο.
Στα Μουσικά Σχολεία (Γυμνάσια) εγγράφονται μαθητές απόφοιτοι Δημοτικού, ύστερα από επιλογή. Η διαδικασία επιλογής για το σχολικό έτος 2016-2017 θα διενεργηθεί από τις αρμόδιες επιτροπές, οι οποίες θα οριστούν από τον Περιφερειακό Διευθυντή Α/θμιας και Β/θμιας Εκπαίδευσης, και θα πραγματοποιηθεί από 16 έως 22 Ιουνίου. Η διαδικασία επιλογής θα ξεκινήσει ταυτόχρονα σε όλα τα Μουσικά Σχολεία της χώρας την Πέμπτη 16-6 και θα διαρκέσει μία ή δύο ημέρες ανάλογα με τον αριθμό των υποψηφίων. Οι θεματικές ενότητες, στις οποίες αξιολογούνται οι υποψήφιοι, είναι: «Ρυθμός», «Ακουστική Ικανότητα», «Φωνητική Ικανότητα», «Διάκριση ηχοχρωμάτων» και προαιρετικά ένα μουσικό όργανο (ευρωπαϊκό ή παραδοσιακό), σε επίπεδο αντίστοιχο τουλάχιστον της Κατωτέρας Σχολής.
 Για την επιτυχία στη διαδικασία επιλογής δεν απαιτούνται προηγούμενες μουσικές γνώσεις ή ειδική προετοιμασία, ενώ οι υποψήφιοι αξιολογούνται αποκλειστικά ως προς την ακουστική και μουσική τους αντίληψη.
Για υποβολή αιτήσεων ή περισσότερες πληροφορίες οι ενδιαφερόμενοι μπορούν να απευθύνονται στη γραμματεία του Μουσικού Σχολείου (τηλ. 2651065457).
Το Μουσικό σχολείο Ιωαννίνων ανακοινώνει ακόμα ότι «με μεγάλη χαρά θα δεχτούμε στο σχολείο μας μαθητές της ΣΤ’ τάξης δημοτικού, προκειμένου να γνωρίσουν από κοντά το σχολείο μας και να ξεναγηθούν στους χώρους του, ύστερα από συνεννόηση στο τηλ.. 2651065457».